HACCPは食品の製造流通に関する安全衛生の基準を設定するものであるため、日本国内でも食品製造関連の会社が既に導入を進めていますが、その影響は製造会社だけではなく、流通を行う会社にも大きな影響を及ぼすものとなっています。
そのため、これらの工程に関する全ての会社が厳格に管理をしなければいけないものであり、食品の製造工場だけがその認可を受ければ良いと言うものではありません。日本では2020年の4月から法律で導入をすることが求められており、1年間の猶予が設けられているものの、これに関する全ての会社がその認証を取得することが求められています。その中でも特に注意しなければならないのは、一般の家庭に至るまでの流通に関わる様々な企業のHACCPに対するスタンスです。HACCPの主な目的は安全に管理された食材を消費者に届けると言う点にあるため、製造過程で万全な管理がなされていた場合でも、流通過程でこれらに問題が生じてしまったのでは意味がありません。
特に販売を行う立場の場合には、衛生管理が非常に難しい側面がありますが、この部分に関して一定の基準を設けて実現をしなければ本来の目的である製造から流通まで安心して食品が管理されていると言う目的を達成することができないことになります。HACCPは非常に厳格な基準が設けられている反面、独自にその基準を設定し実行すると言う柔軟性も持ち合わせています。そのためその趣旨を理解し様々な過程で確実に履行することがHACCPの本来の目的を達成するために必要なこととなります、